Database cgpdb - table Conserved_Orthologs_2002

Showing records 0 - 29 (2185 total)
SQL-query:
SELECT * FROM Conserved_Orthologs_2002 LIMIT 0, 30
     
rows starting from
TIGR_ID description let_est let_exp let_idn let_match let_len let_fr at_l_s at_l_e let_s let_e sun_est sun_exp sun_idn sun_match sun_len sun_fr at_s_s at_s_e sun_s sun_e tom_est tom_exp tom_idn tom_match tom_len tom_fr at_t_s at_t_e tom_s tom_e cor_est cor_exp cor_idn cor_match cor_len cor_fr at_c_s at_c_e cor_s cor_e
 At1g01180.1   hypothetical protein / identical to hyothetical protein GB:AAF26464 GI:6715637 from [Arabidopsis thaliana]   QGB25J11.yg.ab1   0.15   34   37   108   3   16   123   285   602   QHB18G01.yg.ab1   0.47   77   73   94   3   210   303   90   371   7324642   0.46   51   96   187   2   23   196   65   604   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0 
 At1g01220.1   hypothetical protein / similar to unknown protein GB:AAF32477 GI:6957733 from [Arabidopsis thaliana]   QGI7M05.yg.ab1   0.93   75   175   232   3   739   970   6   698   QHE2a11.yg.ab1   0.36   68   64   94   1   962   1055   1   282   18264689   1   76   122   159   3   714   872   3   479   453344   0.58   72   107   147   2   783   929   5   445 
 At1g01290.1   molybdopterin biosynthesis CNX3 protein, putative / similar to molybdopterin biosynthesis CNX3 protein GB:Q39056 from [Arabidopsis thaliana]   QGB20L09.yg.ab1   0.5   49   112   226   1   9   234   160   753   QHE14N03.yg.ab1   0.2   88   44   50   2   220   269   2   151   7409047   0.15   62   40   64   3   204   267   9   200   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0 
 At1g01730.1   expressed protein / ;supported by full-length cDNA: Ceres:3365.   QGF10D03.yg.ab1   0.24   37   63   168   3   65   211   66   566   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   12634560   0.26   36   71   196   3   35   209   33   596   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0 
 At1g01760.1   double-stranded RNA-specific editase, putative / similar to double-stranded RNA-specific editase GB:AAF69673 GI:7770275 from [Danio rerio]   QGC15N05.yg.ab1   0.66   56   134   237   2   2   228   2   712   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   18264527   0.49   79   57   72   3   254   325   402   617   8368776   0.22   64   51   79   1   17   93   151   387 
 At1g01770.1   unknown protein /    QGF24J16.yg.ab1   0.65   55   131   235   3   324   550   3   686   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   5605327   0.32   65   66   101   3   515   610   3   305   4572772   0.28   62   62   99   -3   516   610   473   177 
 At1g01930.1   expressed protein / ;supported by full-length cDNA: Ceres:24737.   QGD6H20.yg.ab1   0.37   45   97   213   2   16   216   68   694   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   8105470   0.54   58   96   165   2   179   340   2   496   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0 
 At1g02020.1   hypothetical protein / predicted by genscan; supported by cDNA: gi_17979092    no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   13681932   0.52   78   91   116   1   148   263   1   348   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0 
 At1g02080.1   unknown protein / Similar to yeast general negative regulator of transcription subunit 1; Location of ESTs gb|T44328 and gb|AA395265   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   5600915   0.79   84   140   165   1   1872   2036   1   495   15499314   0.67   65   133   202   1   1937   2122   1   603 
 At1g02100.1   hypothetical protein / predicted by genscan; supported by cDNA: gi_18377693    no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   QHB42C02.yg.ab1   0.21   61   42   68   3   263   330   3   206   5888440   0.82   72   149   205   1   29   227   1   615   19822138   0.53   66   100   150   1   2   147   73   522 
 At1g02160.1   unknown protein /    no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   16377147   0.23   78   48   61   -1   10   70   470   291 
 At1g02180.1   hypothetical protein / predicted by genemark.hmm   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   QHI24O16.yg.ab1   0.2   51   42   81   3   102   177   3   245   16239812   0.16   33   52   157   1   2   147   103   546   5268591   0.32   42   63   148   2   5   150   152   586 
 At1g02260.1   hypothetical protein /    no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   QHI4A23.yg.ab1   0.16   76   40   52   1   449   500   1   156   5274436   0.49   80   90   112   1   1   112   169   504   13151405   0.86   72   158   218   3   284   499   78   728 
 At1g02330.1   expressed protein / contains similarity to hepatocellular carcinoma-associated antigen 59 GI:7158847 from [Homo sapiens]; supported by cDNA: gi_13937156_gb_AF372932.1_AF372932    no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   QHF11K06.yg.ab1   0.72   73   127   172   1   71   241   85   600   16238162   0.9   69   168   243   3   1   228   3   731   13149473   0.53   58   105   181   -3   99   279   680   153 
 At1g02410.1   hypothetical protein / contains similarity to cytochrome c oxidase assembly protein cox11 GI:1244782 from [Saccharomyces cerevisiae]   QGB8E01.yg.ab1   0.44   91   81   89   2   181   269   2   268   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   15215004   0.56   73   105   143   2   78   216   128   556 
 At1g02680.1   transcription factor TFIID, putative / similar to transcription factor TFIID GB:X84003 GI:791052 from [Homo sapiens]   QGE16E10.yg.ab1   0.44   69   88   127   3   3   125   87   461   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   16245576   0.42   67   83   123   2   7   125   149   511   3191782   0.38   74   75   101   1   25   125   292   591 
 At1g02870.1   expressed protein / ;supported by full-length cDNA: Ceres:5556.   QGJ8B15.yg.ab1   0.72   66   128   192   2   1   192   11   574   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   9504009   0.73   68   135   197   2   1   192   50   631   18162716   0.44   54   88   161   -2   24   183   660   190 
 At1g02960.1   expressed protein / ;supported by full-length cDNA: Ceres:116121.   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   16226142   0.21   35   67   190   -2   285   462   727   179   5006176   0.14   40   37   92   -1   371   460   538   269 
 At1g03030.1   unknown protein / Belongs to PF|01121 Uncharacterized protein family UPF0038 containing ATP/GTP binding domain. ESTs gb|AA585719, gb|AA728503 and gb|T22272 come from this gene   QGE9D03.yg.ab1   0.46   71   79   111   2   221   331   32   364   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   12627083   0.86   77   125   162   3   87   248   180   665   6952677   0.72   68   123   179   3   155   332   30   566 
 At1g03160.1   fructokinase, putative / predicted by genefinder   QGD13J21.yg.ab1   0.31   54   71   130   -1   109   235   395   6   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   12630283   0.25   45   71   156   2   18   157   140   577   13382090   0.32   65   52   79   2   294   372   65   301 
 At1g03180.1   hypothetical protein / predicted by genefinder   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   7333724   0.56   53   115   214   2   3   216   23   649   6020523   0.32   45   80   175   1   56   227   52   558 
 At1g03250.1   expressed protein / EST gb|N96383 comes from this gene;supported by full-length cDNA: Ceres:40461.   QGF25P15.yg.ab1   0.63   65   115   176   1   16   190   178   702   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   16229678   0.74   62   130   209   2   1   204   155   778   19058409   0.49   52   92   176   3   1   174   69   596 
 At1g03330.1   expressed protein / Similar to gb|U85207 snRNP core Sm protein homolog Sm-X5 from Mus musculus. EST gb|AA612141 comes from this gene;supported by full-length cDNA: Ceres:18060.   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   7338653   0.47   92   86   93   1   1   93   115   393   9794358   0.47   92   86   93   2   1   93   101   379 
 At1g03360.1   hypothetical protein / Similar to hypothetical protein SPAC2F7.14c gi|1052797 from Schizosaccharomyces pombe cosmid gb|Z50142   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   QHB35B19.yg.ab1   0.85   77   144   187   -3   47   233   576   16   7321702   0.18   48   47   96   -1   227   322   542   255   6020958   0.29   46   64   138   2   192   322   2   376 
 At1g03600.1   photosystem II protein family / similar to SP:P74367 {Synechocystis sp.}; similar to ESTs emb|Z27038, gb|AA451546, emb|Z29876, gb|T45359 and gb|R90316;supported by full-length cDNA: Ceres:111449.   QGJ8L05.yg.ab1   0.44   77   83   107   2   68   174   56   376   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   12623911   0.5   65   111   169   3   20   174   6   500   6827472   0.44   73   86   117   -2   61   174   582   232 
 At1g03650.1   hypothetical protein / predicted by genefinder   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   4387456   0.25   65   52   80   3   6   85   15   254   9255338   0.49   60   92   151   2   6   153   17   469 
 At1g03687.1   hypothetical protein / predicted by genscan   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   9431447   0.27   50   64   128   3   251   345   66   449   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0 
 At1g03760.1   hypothetical protein / predicted by genefinder   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   6917740   0.34   54   68   124   2   1   122   32   403   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0 
 At1g03910.1   hypothetical protein / predicted by genscan   QGI8M23.yg.ab1   0.96   66   164   246   1   411   648   1   735   QHB14B08.yg.ab1   0.85   70   141   201   3   436   636   57   653   13677985   0.32   87   57   65   -2   608   672   375   181   19351533   0.68   93   111   119   3   554   672   3   359 
 At1g04200.1   unknown protein / Contains similarity to gb|Z69902 from C. elegans; supported by cDNA: gi_20268677    no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   no_hits_found   0   0   0   0      0   0   0   0   8109393   0.88   72   156   215   2   448   662   2   643   7304677   0.64   68   120   174   1   404   577   1   516 
     
rows starting from